Laboratoře ze tří kontinentů potvrzují nákazu hantavirem mezi cestujícími na výletních plavbách
Hantavirus má sníženou mutační kapacitu ve srovnání s jinými patogeny, jako je chřipka nebo koronavirus
Srovnávací genomická analýza mezi pěti infikovanými lidmi na palubě polární výletní lodi MV Hondius potvrdila, že hantavirus byl přenášen z cestujícího na cestujícího během plavby, podle studie zveřejněné na otevřené vědecké platformě Viriological a připravené společně laboratořemi v Jižní Africe, Švýcarsku a Nizozemsku. Vědecké potvrzení podporuje hypotézu používanou od začátku epidemie, která si vyžádala deset infikovaných a tři mrtvé, a po týdnech vyšetřování doplňuje epidemiologický obraz.
„Virové genomy jsou prakticky totožné,“ vysvětlil Blas Oude Munnik, virolog z Erasmus University Medical Center v Rotterdamu a spoluautor studie. Podle výzkumníka se po počáteční infekci z myši na člověka „virus s největší pravděpodobností rozšířil z člověka na člověka na palubě výletní lodi“. Genomické údaje nám však neumožňují vyloučit, že počáteční environmentální expozice zahrnovala více než jednoho cestujícího infikovaného stejným zdrojem, což je neznámé, které bude vyžadovat další epidemiologické informace.
Studie je založena na čtyřech dílčích sekvenčních sekvencích – dvou od pacientů hospitalizovaných v Johannesburgu a dvou v Nizozemsku – a kompletní genomové sekvenci získané od pacienta hospitalizovaného ve Švýcarsku, což je první komplexní analýza viru od začátku propuknutí. Závěry potvrzují, že odpovědným kmenem je andská varianta a vylučují významné mutace, jednu z hlavních obav vědecké komunity od potvrzení ohniska.
„Diagnózu jsme provedli pomocí specifické PCR pro andský hantavirus,“ uvedl Pérez-Rodríguez, zodpovědný za analýzu švýcarského pacienta. Sekvenování, provedené pomocí technologie Illumina, umožnilo porovnat tři segmenty, na které je virový genom rozdělen, a vyloučit přeskupení, tedy výměny genetického materiálu mezi kmeny, které by mohly dát vzniknout novému viru. Identifikovaný kmen se shlukuje těsně s andskými izoláty popsanými v Argentině mezi lety 2018 a 2019, podle Estanislao Nistal Villán, výzkumného pracovníka virologické skupiny na CEU San Pablo University, což naznačuje, že „nejde o příliš odlišnou variantu ani zcela nový kmen“.
Hantavirus má sníženou mutační kapacitu ve srovnání s jinými patogeny, jako je chřipka nebo koronavirus. Sekvenovaný kmen si zachovává přibližně 98% podobnost s lidskými vzorky zjištěnými v Argentině v letech 1997 a 2018, což vykazuje pozoruhodnou genetickou stabilitu po dobu tří desetiletí. Zpráva identifikuje pouze dvě skutečné mutace v celé sekvenci, obě „bez funkčních následků“, což znamená, že nemění nebezpečnost viru.
Přenos andské varianty mezi lidmi – jediný zdokumentovaný s touto kapacitou v rámci rodiny hantavirů – byl stanoven po propuknutí, které se vyskytlo v argentinské Patagonii v letech 2018 až 2019 a po rodinných narozeninách si vyžádalo 34 infikovaných a 11 mrtvých. Vypuknutí MV Hondius představuje první zdokumentovanou mezinárodní epizodu šíření tohoto kmene mezi lidmi na palubě dopravního prostředku a vědecká koordinace mezi laboratořemi na třech kontinentech umožnila rekonstruovat řetězec nákazy během několika týdnů.
